梵字是神聖的文字，相傳是宇宙之主「大梵」創造的文字。目前所知的梵字有天城體、札蘭體、悉曇體等。就如同中文有草書、行書、楷書等字體一樣，其中又以悉曇體最為殊勝。
「悉曇」的意思為「成就」。不空三藏教授密藏真言，都是用梵字，對於梵字的看法是：「學之書之誦之，必證不壞法身也。」也說：「咒由心生，心本不生，故咒亦不生也。能知法本不生，咒亦無性，如此受持陀羅尼方能證聖。」
在佛教密要金剛乘中，完整的宇宙形態是由金剛界與胎藏界兩大曼陀羅所組成，其它的曼陀羅都是這兩大部曼陀羅原本內有的一部份放大或延伸。胎藏界曼陀中十二院的主持者加上中央界的根本佛，就形成了十三佛的信仰，是日本十分普遍的信仰象徵。
種子字是指宇宙中一切事物，都有象徵的梵字，來代表其本質。在聖曼陀羅裡，以十三佛種子字來做為胎藏界的象徵。
這十三位聖尊分別是：大日如來、釋迦如來、開敷華王如來、寶生如來、阿彌陀如來、觀世音菩薩、大勢至菩薩、文殊菩薩、普賢菩薩、地藏菩薩、彌勒菩薩、虛空藏菩薩、及不動明王。
由大日如來主持中央的中台八葉院，四如來及八大菩薩分別掌持遍知院、蓮花部院、金剛手院、持明院、彌勒院、文殊院、地藏院、除蓋障院、虛空藏院、蘇悉地院、及外金剛部院。
在佛教信仰中，種子字等同於佛像，甚至比佛像更能代表佛菩薩本身親在。十三佛種子字等於是整個宇宙，胎藏界曼陀羅顯現於聖曼陀羅之中。憑藉十三佛菩薩的加持，能使聖曼陀羅有如宇宙一切萬物的本質，及具足一切十方諸天神佛的功德，其效驗宏大，不可思議。